З перших днів подій на Сході Сергій Никоненко брав активну участь в організації блок-постів на під’їздах до міста. Одним із перших долучився до волонтерського руху: доставляв допомогу від жителів міста та району в зону АТО для бійців батальйону "Айдар".

З червня 2014 року вступив до складу  батальйону "Айдар". Сергій Никоненко був батьком і братом для своїх бійців - йому довіряли, його любили. Він до останнього мужньо та самовіддано боронив рідну землю. 18 січня 2015 року, в результаті нічного обстрілу терористами системами "Град" села Трьохізбенка Новоайдарського району Луганської області, Cергій Никоненко загинув. Сьогодні у Миргороді оголошено День жалоби за загиблим учасником АТО Сергієм Никоненком.

Ми в скорботі за земляком, який віддав своє життя, відстоюючи незалежність та цілісність Української держави. Він до останнього мужньо та самовіддано боронив рідну землю.Вічна і світла пам'ять герою,-- сказав  міський голова Сергій Соломаха.

Похоронили миргородського героя-айдарівця з належними військовими почестями. Ця затьмарена печаллю звістка в траурній тузі схилила голови всіх, хто знав цю людину. У жалобній церемонії, яка відбулася на центральній площі Миргорода, взяли участь керівники міста, району, області, громадськість.